病情分析：精子畸形率为99%时，可能会增加胎停或流产风险。
精子畸形率高会影响精子的质量和活力，进而影响受精卵的形成和着床，可能导致胚胎停止发育或流产。
若患者存在子宫内膜异位症、黄体功能不足等疾病，也可能会导致胎停或流产的发生概率增加。
建议孕妇定期进行孕期检查，监测胎儿健康状况，同时关注生殖道感染史、药物使用史以及是否存在遗传病家族史等因素，以降低不良妊娠结局的风险。