病情分析：卵巢囊肿5厘米怀孕了通常有影响。
卵巢囊肿5厘米属于较大的囊肿，会对周围器官产生一定的压迫作用，进而影响到正常的生育功能，不利于胚胎的正常生长发育。
如果患者存在子宫内膜异位症、多囊卵巢综合征等疾病，这些疾病也可能导致月经不规律。因此，在考虑是否为早孕时，需要排除这些因素的影响。
针对卵巢囊肿患者的妊娠管理需谨慎，并建议定期监测囊肿大小以及孕妇的身体变化，以评估风险并及时处理。