病情分析：

男性先天性发育不良的原因可能是遗传因素、激素水平异常、染色体异常等。

1、遗传因素

先天性发育不良通常是指在胚胎发育时期，由于基因突变或者染色体异常等因素引起的发育异常，属于一种遗传性疾病，会导致生殖器官畸形。

2、激素水平异常

男性先天性发育不良，可能是体内的激素水平异常所造成的，比如雄激素分泌不足，可能会影响到正常的性功能，导致性功能障碍。

3、染色体异常

男性先天性发育不良，也可能是染色体异常所造成的，比如染色体易位、倒位等。

除了以上原因，还可能是母体因素、环境因素等原因，建议患者及时前往医院检查，明确病因后，遵医嘱进行对症治疗。