病情分析：精子形态分析正常率为3%通常意味着存在严重的精子形态异常，可能影响正常怀孕。
正常的精子形态是保证精子能够顺利通过女性生殖道并与卵子结合的关键因素之一。当精子形态异常时，其运动能力下降，受精成功率降低，从而导致难以正常怀孕。
虽然这种情况严重程度较高，但若患者及时就医，在医生指导下使用克罗米芬、来曲唑等药物改善精子质量后仍有可能实现正常怀孕。
建议患者在考虑生育前进行全面的生育评估，包括配偶双方的生育能力和生活习惯，以确保最佳的孕育条件。