病情分析：女性肚子痛腰疼的原因有子宫内膜异位症、慢性盆腔炎等疾病。异位的子宫内膜病灶会随着卵巢的周期性变化而出现周期性出血的情况，会引起盆腔周围组织粘连，从而引起腰疼和小腹疼。慢性盆腔炎会有炎性的渗出，引起盆腔周围组织的粘连，可能会引起腰疼和小腹疼痛。特别是骶韧带发生炎症时，可能会引起腰骶部疼痛。