病情分析：怀孕39天未见卵黄囊是否正常，要根据具体情况判断。如果患者月经周期长，排卵期推迟，怀孕40天可能刚刚测到怀孕，只能是抽血才能查到怀孕，B超可能见不到孕囊及卵黄囊。这种情况下见不到卵黄囊是正常的，一般一周后复查B超可以见到卵黄囊。如果患者月经周期28到30天，排卵期比较准时，怀孕40天没有见到卵黄囊，那么预示着胚胎发育不良。