病情分析：衣原体肺炎和小儿支原体肺炎的主要区别是引起疾病发作的病原体不同。肺炎衣原体是由衣原体感染引起的肺部炎症性病变，支原体肺炎是支原体感染引起的肺炎的一种表现。这两种病原体感染引起的肺炎的症状和体征相似，使用的药物基本相同。因此可以使用同类药物进行治疗，也可以根据细菌培养和药敏试验的检查结果选择合适的药物。