病情分析：三个月婴儿脑发育不良，主要的问题就是影响孩子的发育，包括运动的发育、语言的发育、智力方面的发育等。出现脑发育不良原因还不太明确，考虑是多个因素导致的，例如宫内发育不良、基因突变。在怀孕期间的饮食接触物等都有一定的影响，放射线、化学制剂或者有保胎史，有一些疾病或者用药史的都有影响。