病情分析：一般来说，大便中最常见的真菌是孢子菌 。如果患者检查便常规发现有这种真菌感染的话，一般来说是不会自愈的。因此建议患者应该及时到消化内科就诊，可以选择口服地衣芽孢杆菌活菌胶囊和益生菌等药物来调整肠道菌群，帮助促进这种疾病痊愈。如果真菌感染比较严重引起的急性肠胃炎症状，就需要积极配合口服制霉菌素片等药物来治疗。同时患者应该注意饮食卫生，避免再次感染其他细菌。