病情分析：新生儿室间隔缺损三毫米不太严重，三毫米属于微小缺损。出现室间隔缺损，要立即去医院通过心电图、心脏彩色多普勒超声确定室间隔缺损的类型、膜周缺损、肌肉缺损。另外再根据分类决定下一步的治疗方案，缺损的治疗分为介入微创治疗和开胸修补治疗，两者都可以达到根治的目的，使患者尽快康复。