病情分析：

牙根发黑疼痛可能是牙龈炎、龋齿、根尖周炎等导致的，需要根据具体情况进行治疗。

1、牙龈炎

如果平时不注意口腔卫生，可能会导致牙菌斑和牙结石堆积，刺激牙龈部位，从而出现牙龈出血、牙龈颜色异常等症状。建议遵医嘱服用阿莫西林胶囊、甲硝唑片等药物进行治疗。

2、龋齿

如果经常吃甜食，并且没有做好口腔的护理工作，可能会导致口腔内滋生细菌，从而引起龋齿，出现牙齿发黑、疼痛等症状。建议通过复合树脂充填、嵌体修复等方式进行治疗。

3、根尖周炎

通常是由于细菌感染引起的，可能会导致牙龈出现脓肿、疼痛等症状。建议遵医嘱服用阿奇霉素胶囊、头孢克肟胶囊等药物进行治疗。

除此之外，还可能是牙龈瘘管等导致的，建议及时就医诊治，以免延误病情。