病情分析：月经结束两天同房射进去了有怀孕的可能性。
月经结束后两天，女性体内可能仍存在一定量的未被完全排出的卵子，且子宫内膜开始修复，具备一定的受孕条件。因此，即使是在月经结束后的短时间内进行性行为并射精，仍然存在怀孕的风险。
如果女性处于排卵期，则怀孕几率较高；若在非排卵期则怀孕概率较低。
建议采取避孕措施以减少意外怀孕的风险，并监测身体变化，如有不适及时就医。