病情分析：重症监护室患者使用呼吸机是为了支持或替代自主呼吸，长期使用会导致肺萎陷和肌肉废用性萎缩，进一步影响自主呼吸。
长时间使用呼吸机时，由于呼吸肌不活动，可能导致胸廓肌肉、膈肌等出现废用性萎缩，从而影响到自主呼吸的能力。此外，长期依赖呼吸机可能会引起二氧化碳潴留，进一步降低自主呼吸的功能。因此，为了确保患者的舒适度和安全性，应定期评估是否可以停止使用呼吸机，并逐步训练患者的自主呼吸能力。
但是需要明确的是，即使在ICU中使用了呼吸机，也不意味着患者完全失去了自主呼吸的能力。对于一些轻至中度疾病的患者来说，在使用呼吸机辅助下仍可能保留部分自主呼吸功能。
需要注意的是，尽管使用呼吸机可以帮助重症患者维持生命，但长期依赖可能会导致身体机能下降，建议尽早开展康复治疗以恢复自主呼吸和生活自理能力。