病情分析：大便常规查出有真菌孢子的情况代表可能患者肠道中受到真菌感染而造成的。这种情况的患者可以选择内服一些相关的药物进行治疗，当然在治疗期间需要观察效果，如果没有好转的话还是应该及时到正规的医院和医生进行沟通，然后再选择对症的方式治疗。