病情分析：耐多药肺结核治疗两年后可能不会完全康复。
由于结核分枝杆菌存在变异现象，可能会出现复治失败的情况，此时需要联合使用多种二线抗结核药物进行治疗，如氟喹诺酮类、注射用硫异烟胺等。
如果患者在耐多药肺结核治疗期间能够遵循医嘱规范用药，并且没有发生耐药性增强或其他并发症，则通常预后较好。
针对耐多药肺结核的治疗需严格遵照医嘱执行，并定期监测病情变化以及药物副作用。同时，应加强营养支持，保持充足休息，以利于机体恢复健康状态。