病情分析：三个月宝宝干咳干呕可能是由胃食管反流、上呼吸道感染、支气管炎、哮喘、先天性气道发育异常等引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。
1.胃食管反流
由于婴幼儿贲门括约肌尚未发育完全，导致胃内容物逆流入食管，刺激咽喉部引起干咳、恶心呕吐等症状。可遵医嘱使用促胃肠动力药进行治疗，如多潘立酮混悬液、枯草杆菌二联活菌颗粒等。
2.上呼吸道感染
由病毒或细菌侵袭上呼吸道黏膜引起的炎症反应，会导致局部水肿和分泌物增多，从而引起咳嗽和恶心的症状。针对病毒感染所致者，可遵照医生的意见给予抗病毒药物进行处理，比如磷酸奥司他韦颗粒、扎那米韦吸入粉雾剂等；若是细菌感染，则需选用合适的抗生素进行治疗，例如阿莫西林胶囊、头孢克肟颗粒等。
3.支气管炎
支气管炎是由各种因素导致的支气管黏膜及其周围组织的急性或慢性非特异性炎症，炎症因子刺激可引起干咳、胸闷、呼吸困难等症状。对于急性发作期的患儿，可按医嘱用布吸入气雾剂联合硫酸沙丁胺醇气雾剂进行缓解。若为慢性持续期，则需要长期规律吸入糖皮质激素以控制病情，常用药物包括丙酸倍氯米松气雾剂、布吸入气雾剂等。
4.哮喘
哮喘是一种慢性气道炎症性疾病，主要表现为反复发作的喘息、咳嗽、气促和胸闷，严重时可出现呼吸困难。家长可在医师指导下给其使用短效β2受体激动剂来缓解急性发作，如硫酸特布他林雾化溶液、富马酸福莫特罗粉吸入剂等；也可使用吸入性糖皮质激素进行长期管理，如丙酸氟替卡松吸入气雾剂、布吸入气雾剂等。
5.先天性气道发育异常
先天性气道发育异常是指出生时就存在的肺部结构缺陷，可能导致气道狭窄或不畅，引起咳嗽、呼吸困难等症状。此类患儿通常需要手术矫正，常见手术方式有经鼻导管氧疗、气管插管术等。
建议密切观察孩子的症状变化，定期复查，以便及时发现并处理可能的并发症。同时注意保持室内空气清新流通，避免接触已知过敏原，以减少干咳的发生。