病情分析：三岁宝宝眼睛里面有小囊肿可以考虑眼部囊肿穿刺引流、抗炎药物治疗、热敷治疗、激光治疗、手术切除等治疗措施。由于囊肿可能伴随感染或影响视力，应尽快就医以获得专业评估和治疗。
1.眼部囊肿穿刺引流
眼部囊肿穿刺引流通过抽取囊肿内的液体来减轻压力和症状。此方法适用于表浅且较大的眼睑内囊肿。
2.抗炎药物治疗
抗炎药物治疗旨在缓解由感染引起的炎症反应。对于有感染迹象的小囊肿，可考虑使用非处方外用药膏如红霉素软膏、莫匹罗星软膏等局部涂抹。
3.热敷治疗
热敷可以促进血液循环，缓解疼痛和不适感。若囊肿伴有轻微疼痛或发红，可尝试使用温度适宜的湿毛巾轻轻敷于患处。
4.激光治疗
激光治疗利用高能量光束直接作用于病变组织，有助于缩小或消除囊肿。小型无症状的眼周囊肿可通过专业医师操作低能量激光进行处理。
5.手术切除
手术切除是通过外科手段移除异常组织的方法。当囊肿较大或位置特殊引起视力障碍时，应考虑在全麻下进行开放性手术。
无论选择哪种治疗方法，都应注意保持眼部卫生，避免用手揉搓眼睛。同时，定期复查以监测病情变化也是非常必要的。