阴茎末端隐隐作痛多考虑是过度摩擦引起的，但也不排除是龟头炎、前列腺炎等原因导致的，需要在明确病因后接受治疗。
1、过度摩擦
如果患者日常生活中穿了比较紧身的内裤，或者是经常进行剧烈的活动，可能会导致阴茎部位持续受到摩擦，出现上述症状。建议患者穿宽松舒适的内裤，也要避免经常进行剧烈的活动。
2、龟头炎
如果包皮比较长而且不注意局部清洁卫生，可能会导致局部受到细菌感染，诱发龟头炎后，就会导致阴茎部位出现红肿、疼痛等不适的症状。患者可以在医生的指导下使用红霉素软膏、夫西地酸乳膏等药物改善症状。
3、前列腺炎
如果患者在日常生活中不注意生殖器部位的清洁护理，导致前列腺部位受到细菌感染，也有可能会导致阴茎部位出现疼痛、尿频、尿急等不适的症状。患者可以在医生的指导下服用盐酸坦索罗辛缓释胶囊、盐酸环丙沙星胶囊等药物改善症状，同时也需要注意局部的清洁护理。
除上述较为常见的原因外，还有可能是阴茎炎、尿道炎、生殖器疱疹等原因导致的，需要及时就医诊断。