腘窝囊肿做完手术之后膝盖疼，可能是由局部感染、膝关节积液、膝关节半月板损伤、膝关节骨性关节炎、腘窝囊肿复发等原因引起的。
1、局部感染
腘窝囊肿是指腘窝深部滑囊肿大或膝关节滑膜囊肿向后突出于皮下的一种囊肿。腘窝囊肿手术后如果没有做好护理工作，可能会导致局部感染，从而引起膝盖疼痛的症状。患者可以在医生指导下使用红霉素、头孢克肟等药物进行抗感染治疗。
2、膝关节积液
如果患者在腘窝囊肿手术后，没有做好局部的护理工作，导致局部出现炎症反应，可能会引起膝关节积液的情况，从而引起膝盖疼痛的症状。患者可以在医生指导下使用塞来昔布、阿司匹林等药物进行治疗。
3、膝关节半月板损伤
如果患者在腘窝囊肿手术后，出现膝关节半月板损伤的情况，也可能会引起膝盖疼痛的症状。患者可以在医生指导下使用双氯芬酸钠、吲哚美辛等非甾体抗炎药进行治疗。
4、膝关节骨性关节炎
膝关节骨性关节炎是一种以关节软骨损害为主，累及整个关节组织的关节疾病，多表现为关节疼痛、压痛、关节肿胀等症状。如果患者病情比较严重，可以通过手术的方式进行治疗。但腘窝囊肿手术后可能会导致膝关节骨性关节炎，从而引起膝盖疼痛的症状。患者可以在医生指导下使用硫酸氨基葡萄糖、硫酸软骨素等药物进行治疗。
5、腘窝囊肿复发
如果患者在腘窝囊肿手术后没有做好护理工作，导致病情复发，也可能会引起膝盖疼痛的症状。患者可以再次通过手术的方式进行治疗。
在日常生活中，患者要注意做好保暖措施，避免着凉，注意清淡饮食，避免食用辛辣刺激性食物。如果患者出现不适症状，建议及时就医治疗。