药物流产并非任何时间都适宜，一般来说，怀孕35-49天是相对合适的时段。
怀孕35-49天，胚胎发育尚处于早期阶段，孕囊大小适中，一般直径在2-3厘米。此时，胚胎着床尚浅，与子宫壁的连接还不十分紧密。较小的孕囊更容易受到药物作用的影响，能更顺利地从子宫壁脱离，从而提高药物流产的成功率。若怀孕时间过短，孕囊太小，超声检查可能难以准确确定其位置，容易导致漏吸；若怀孕时间过长，孕囊过大，与子宫壁的附着紧密，药物流产时可能出现流产不全，需要二次清宫，对女性身体伤害较大。
目前常用的药物流产方案是米非司酮联合米索前列醇。米非司酮能使子宫蜕膜变性坏死、宫颈软化，米索前列醇则能兴奋子宫，促进子宫收缩，促使胚胎排出。在怀孕35-49天，女性体内的激素水平和子宫环境对这两种药物的反应较为理想。子宫对米索前列醇的收缩反应良好，能有效推动胚胎排出体外，同时，此时女性身体的耐受性也较好，能较好地承受药物流产过程中可能出现的不适。
如需进行药物流产，患者必须在正规医疗机构进行。在决定药物流产前，要进行全面检查，如B超、血常规、凝血功能检查等。流产后要密切观察阴道出血情况，若出血过多或腹痛剧烈，应及时就医。