长期食用眼药水对眼睛的危害主要包括眼部不适、角膜损伤、视神经炎、虹膜缺损等。建议患者严格按照医嘱使用药物，避免因用药不当，对身体造成不适。
1.眼部不适：眼药水的主要成分通常为防腐剂、抗生素、激素类药物等，如果长期频繁使用眼药水，可能会影响结膜杯细胞外基质合成和降解的平衡，从而引起眼部干涩、刺痛、异物感等症状。
2.角膜损伤：眼药水中含有的防腐剂，可破坏角膜上皮屏障功能，使细菌入侵角膜组织，并引发感染。而且眼药水中的防腐剂还可能导致泪液中蛋白质变性，进一步加重角膜损伤的情况。另外，部分眼药水属于激素类药物，如妥布霉素地塞米松滴眼液，长期使用后会导致眼压升高，增加青光眼的风险。
3.视神经炎：眼药水中含有防腐剂，会对视神经产生一定的刺激作用，长期使用后会增加罹患视神经炎的概率。
4.虹膜缺损：眼药水中常见的防腐剂有苯扎溴铵，其具有较强的杀菌作用，在抑制细菌的同时也会杀灭正常的眼球组织，长期大量应用时可影响到虹膜色素生成，甚至还会导致虹膜缺损。
在日常生活中避免滥用眼药水，以免损害身体健康。此外，若自身存在眼部不适症状，还需及时前往眼科就诊，完善体格检查、裂隙灯检查等相关检查以明确诊断，并积极配合医生进行针对性处理。