早上起来尿液是深黄色可能是生理因素引起的，也可能是尿路感染、急性肾小球肾炎、膀胱炎、肾结石等原因导致的，患者需要根据病因对症治疗 。
1、生理因素
如果患者在平时饮水过少，可能会导致尿液浓缩，从而出现上述情况。通常属于正常的生理现象，不需要特殊治疗，患者可以通过多喝水来改善。
2、尿路感染
如果患者存在尿路感染的情况，可能会导致尿液中存在炎性分泌物，从而出现上述现象。患者可以在医生指导下服用盐酸左氧氟沙星胶囊、头孢呋辛酯片等药物进行治疗。同时，患者还需要注意多喝水，促进尿液排泄。
3、急性肾小球肾炎
如果患者存在急性肾小球肾炎，会导致肾小球损伤，从而使尿液发生浓缩，出现上述现象。患者可以在医生指导下服用呋塞米片、氢氯噻嗪片等药物进行治疗。同时，患者还需要注意避免过度劳累，以免加重病情。
4、膀胱炎
如果患者存在膀胱炎，会导致膀胱黏膜充血、水肿，在尿液排出后，尿液会被稀释，从而出现上述现象。患者可以在医生指导下服用头孢克肟胶囊、阿莫西林胶囊等药物进行治疗。同时，患者还需要注意保持清淡饮食，避免食用辛辣刺激的食物，如辣椒、花椒等。
5、肾结石
如果患者存在肾结石，而且肾结石体积比较大，可能会导致尿路梗阻，从而出现上述现象。建议患者及时到正规医院通过冲击波碎石术进行处理。必要时，患者也可以通过手术方式进行治疗。
除以上情况外，泌尿系统结核、肝脏疾病等原因也可能会导致上述情况，建议患者尽快明确病因，在医生的指导下进行相应的处理。患者在日常生活中，应该注意个人卫生，避免不洁的性生活。还要注意多喝水，饮食均衡，可以进行适当锻炼，避免过度劳累。