不能说基因突变一定是恶性的。基因突变可能是良性改变，也可能是恶性改变。
基因突变是指DNA分子发生碱基对替换、插入和/或缺失等结构变异的现象，具有随机性、普遍性等特点。在大多数情况下，基因突变不会引起疾病，因为人体有很强的修复机制，可以识别并纠正错误的DNA序列，此时一般是良性改变。
然而，在某些情况下，基因突变可能会导致细胞功能异常，从而引发疾病。对于恶性肿瘤来说，基因突变通常与恶性肿瘤细胞的发生和发展密切相关。例如，一些常见的致癌基因突变包括BRCA1/2基因突变、EGFR突变、ALK重排等。这些突变可以使恶性肿瘤细胞生长和扩散不受控制，并且可能会影响患者的治疗效果和生存时间。
总之，虽然大部分基因突变并不会导致疾病，但对于恶性肿瘤患者而言，了解具体的基因突变类型有助于制定个性化的治疗方案，提高疗效和生活质量。