女性服用玄驹胶囊是否可以保护卵巢需要根据具体情况进行分析。如果患者存在肾阳虚的情况，则可以在医生指导下使用该药物进行治疗，此时是有用的。但如果患者不存在肾阳虚的情况，则对卵巢没什么作用。
若患者出现腰膝酸软、畏寒肢冷等症状，并且经中医辨证为肾阳虚，此时则可以在医生的指导下服用玄驹胶囊来进行调理。因为该药具有温肾助阳的功效，能够有效改善患者的不适症状。但是需要注意的是，在用药期间要严格遵医嘱服用，避免自行盲目用药，以免引起不良反应。
但如果患者不存在上述情况，则不建议服用此药来保护卵巢。因为该药并不具有直接的作用，而且也不适合所有的人群服用。对于无明显不适症状者应禁止使用，以免产生不良影响。
另外，建议患者在日常生活中要注意休息，保持充足的睡眠时间，避免熬夜。同时还要注意个人卫生，勤换洗内裤，以免受到细菌感染而诱发妇科疾病的发生。必要时可到医院就诊处理。