喝了放三天的水中毒肚子疼可能是由于细菌感染、胃肠功能紊乱、急性胃肠炎、食物中毒、胃溃疡等原因所引起的，需要根据病因进行治疗。
1、细菌感染
如果放置三天的水没有做好消毒措施，可能会导致其中滋生大量的细菌，从而出现腹痛、腹泻等症状。患者可以在医生的指导下服用抗生素类药物进行治疗，比如阿莫西林胶囊、头孢克肟颗粒等。
2、胃肠功能紊乱
如果患者本身存在胃肠功能紊乱的情况，在喝了放置三天的水之后可能会加重病情，从而出现腹痛、腹泻等症状。患者可以遵医嘱服用促进胃动力的药物进行治疗，比如多潘立酮片、枸橼酸莫沙必利片等。
3、急性胃肠炎
如果放置三天的水中含有大量细菌，患者饮用后会对胃肠道黏膜造成刺激，从而诱发急性胃肠炎的情况。患者可以遵医嘱服用止泻类药物进行治疗，比如蒙脱石散、复方黄连素片等。
4、食物中毒
如果放置三天的水中存在有毒物质，可能会诱发食物中毒的情况。此时患者需要及时去医院进行洗胃治疗。
5、胃溃疡
如果本身患有胃溃疡的疾病，在喝水前没有将水加热，可能会导致胃黏膜受到损伤，从而出现腹痛、反酸等症状。此时患者可以遵医嘱服用奥美拉唑肠溶片、雷贝拉唑钠肠溶片等药物抑制胃酸分泌。必要时，患者也可以通过手术的方式进行治疗。
除此之外，还有可能与肠易激综合征、溃疡性结肠炎等原因有关，建议患者及时去医院就医，以免延误病情。