管苁蓉一般是指管菖蒲，肉苁蓉一般是指肉苁蓉。两者的区别在于来源不同、外观不同、功效不同、治疗病症不同、禁忌不同等。
1、来源不同
管菖蒲是一种中药材，为天南星科植物管菖蒲的干燥根茎。肉苁蓉是一种中药材，为肉苁蓉科植物肉苁蓉或管苞肉苁蓉的干燥带鳞叶的肉质茎。
2、外观不同
管菖蒲的外观呈不规则状，多呈不规则长条状，长可达60cm，宽可达15cm。肉苁蓉的外观呈类圆形，多呈纺锤状，长可达2.5cm，宽可达4.5cm。
3、功效不同
管菖蒲具有开窍醒神、化浊开肠、解毒辟秽的功效，可用于治疗闭证神昏、中风痰迷、小儿惊风、健忘失眠、耳鸣耳聋、脘痞胀痛、泄泻、痢疾等病症。肉苁蓉具有补肾阳、益精血、润肠通便的功效，可用于治疗肾阳不足、精血亏虚、腰膝酸软、肠燥便秘等病症。
4、治疗病症不同
管菖蒲适用于治疗痰蒙清窍、神志昏迷、小儿惊风、健忘失眠等病症。肉苁蓉适用于治疗肾阳不足、精血亏虚、腰膝酸软、肠燥便秘等病症。
5、禁忌不同
管菖蒲不可与麦冬同用，两者药性相反，同用会影响药效。此外，阴虚火旺及便溏泄泻者慎服肉苁蓉。
建议患者在医生指导下使用药物，避免自行用药，以免出现不良反应，造成病情加重。如果患者服用药物后出现不适症状，建议及时去医院就医，以免延误病情。