甲母痣大于3毫米不一定就是恶性的，还需要根据其他的情况进行综合考虑。
甲母痣属于长在指甲上的一种色素痣，可能是先天性发育不良引起的，也可能是家族遗传史引起的。随着病情的发展，可能会导致指甲的颜色发生改变，甚至还会出现指甲的形状发生改变等情况。如果甲母痣大于3毫米，但是身体没有出现其他不适症状，通常是不严重的，患者不需要过分担心，也不需要特殊治疗。
如果甲母痣大于3毫米，并且伴随着持续增大的情况，而且出现了局部的瘙痒和疼痛等现象，此时可能是恶性的。建议患者及时去正规医院的皮肤科，通过病理检查的方式进行判断，如果确诊为恶性肿瘤，可以通过手术切除病灶的方式进行治疗，也可以进行放射疗法治疗。
在日常生活中，患者要注意自身的饮食健康，尽量多吃富含维生素的食物，也可以多吃富含蛋白质的食物，从而为身体补充所需要的营养。