睡醒之后耳朵一侧疼可能是由耳部受压、耵聍栓塞、外耳道炎、中耳炎、外耳道疖肿等引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。
1.耳部受压
睡眠过程中长时间保持同一姿势可能导致耳部软组织受到压迫，血液循环不畅，从而引起局部缺血缺氧和张力增加而出现疼痛。建议患者适当按摩并调整枕头高度可缓解不适感。
2.耵聍栓塞
耵聍分泌过多或者排出受阻会导致耵聍积累形成硬块，当其体积增大时会对耳道壁产生压力，进而引起耳痛、耳道瘙痒、耳内闷胀感的症状。患者可通过温热毛巾敷于患处、酒精棉签轻拭等方法软化耵聍后取出。
3.外耳道炎
外耳道炎通常由细菌感染引起，炎症因子刺激外耳道黏膜，导致局部充血水肿，从而引起耳痛、耳闷、听力下降的现象发生，可伴有头痛、发热和全身不适等症状。患者可在医生指导下使用抗生素类药物进行治疗，如头孢克肟颗粒、阿莫西林胶囊等，可用温开水整片吞服。
4.中耳炎
中耳炎多是由于病毒侵袭机体诱发上呼吸道感染所致，致病菌通过咽鼓管进入中耳，引发炎症反应，炎症因子刺激中耳部位神经，就会出现耳痛、耳道流水或流脓、听力下降、耳鸣的情况。患者可以遵照医生指示用消炎止痛药膏进行涂抹，比如复方醋酸铝滴耳液、盐酸金霉素软膏等。
5.外耳道疖肿
外耳道疖肿主要是因为外耳道皮肤毛囊或皮脂腺受到损伤或感染引起的急性化脓性病变。此时炎症会刺激外耳道，导致局部红肿、疼痛等症状的发生。针对外耳道疖肿，如果已经成熟，则需要切开引流；若未成熟则需遵医嘱使用鱼石脂软膏、碘伏等药物进行治疗，可用棉签蘸取软膏、碘伏沿顺时针或逆时针向外画圈涂抹。
建议患者定期清洁外耳道，避免使用尖锐物品清理以免加重损伤。同时患者注意休息，避免熬夜，保证充足睡眠，以减少耳部不适的发生。