早上起来牙根疼多考虑是因为龋齿、牙龈炎、牙周炎、根尖周炎、牙髓炎等疾病导致，需要根据不同的疾病选择不同的治疗。
1、龋齿
龋齿是一种常见的口腔疾病，主要是因为细菌感染、口腔环境差等原因导致，患者会出现牙齿变黄褐、缺损以及疼痛等症状。患者可以在医生的指导下使用氟化亚锡、氟化铵等药物进行治疗，也可以通过修复手术进行治疗。
2、牙龈炎
牙龈炎是指牙龈边缘软组织的炎症，可能与牙菌斑、食物嵌塞、牙结石等因素有关，患者可能会出现牙龈出血、龈沟液增多、龈缘变厚等症状。建议患者可以在医生的指导下使用复方氯己定含漱液漱口，抑制牙菌斑滋生，也可以通过牙龈成形术进行治疗。
3、牙周炎
可能因牙齿表面牙菌斑形成过多，诱发牙周炎，会出现牙龈出血、牙龈与牙齿分离、牙龈退缩等情况。患者可遵医嘱使用复方氯己定含漱液、过氧化氢溶液进行改善，必要时可以通过牙周刮治术、翻瓣术治疗。
4、根尖周炎
根尖周炎是指发生在根尖周围组织的炎症性病变，可能是因为细菌感染、物理刺激等原因导致，患者会出现牙齿咬合痛、根尖部位肿胀等症状。患者可以在医生的指导下使用阿莫西林胶囊、甲硝唑片等药物进行治疗，也可通过根管治疗术进行治疗。
5、牙髓炎
若患者本身患有牙髓炎，但没有及时治疗，可能会导致炎症加重，可能会出现严重的牙痛。患者可遵医嘱口服阿莫西林胶囊、罗红霉素片等药物，控制炎症，减轻疼痛。若疼痛不能缓解，患者可遵医嘱口服布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片等药物，缓解疼痛。
患者要及时去医院就医，明确病因后在医生的指导下进行治疗。