女性肛门长了水泡，可能是肛周湿疹、肛周脓肿、痔、单纯性疱疹、直肠息肉等原因导致的，具体需要明确病因后进行治疗。
1、肛周湿疹
如果患者不注意个人卫生，长时间不更换内裤，导致肛门部位长时间处于潮湿的环境中，就可能会诱发肛周湿疹，出现肛门部位起水泡、瘙痒等症状。患者可在医生的指导下使用他克莫司软膏、吡美莫司乳膏等药物进行治疗，同时还要注意局部的清洁卫生。
2、肛周脓肿
如果患者平时不注意饮食，长时间吃辛辣、刺激的食物，就可能会导致大便干结，在排便时可能会导致肛周皮肤破损，从而引起肛周脓肿，出现肛门部位起水泡、疼痛等症状。患者可以在医生的指导下使用甲硝唑片、阿莫西林胶囊等药物进行治疗，同时还要注意清淡饮食，避免吃辛辣、刺激的食物。
3、痔
痔可能是不良的排便习惯、长期饮酒等原因导致的，可能会出现便血、肛门瘙痒、疼痛等症状。建议患者可以遵医嘱使用痔疮栓、复方角菜酸酯栓等药物进行治疗，也可以通过温水坐浴的方式缓解症状。
4、单纯性疱疹
单纯性疱疹是由单纯疱疹病毒感染引起的皮肤病，会出现起水泡的症状，还可伴有疼痛、发热等。对于症状轻微的患者，一般不需要进行特殊治疗，可以通过适当喝水，促进新陈代谢，有利于疾病恢复。但如果患者症状比较严重，则需要在医生指导下使用阿昔洛韦、伐昔洛韦等抗病毒药物进行治疗。
5、直肠息肉
直肠息肉是指直肠黏膜表面发生隆起性病变，可能与长期吸烟、喝酒、高脂饮食等因素有关，患者可能会出现便血、黏液便等症状。建议患者可以在医生的指导下通过内镜下息肉电切除术的方式进行治疗，也可以通过经肛门行直肠息肉摘除术的方式进行治疗。
在日常生活中，建议患者注意饮食清淡，可以多吃膳食纤维丰富的水果和蔬菜，如柚子、丝瓜、茄子等，保证足够的睡眠，避免熬夜，少吃辛辣刺激油腻的食物，如辣椒、炸鸡、烤鸭等。症状严重时建议及时就医治疗，以免延误病情。