三个月婴儿大脚趾一侧发红，可能是由于生理性因素引起的，但也可能是由于蚊虫叮咬、外伤、过敏、湿疹等因素引起的，建议家长及时带婴儿到医院就诊，明确病因后进行治疗。
1、生理性因素
如果室内温度过高，或者是婴儿穿的鞋子过紧，可能会导致局部血液循环不畅，从而引起上述症状出现。通常属于正常的生理现象，不需要特殊治疗，家长可以通过调节室温以及给婴儿更换宽松的鞋子来改善症状。
2、蚊虫叮咬
如果婴儿在睡觉时，大脚趾部位受到蚊虫叮咬，可能会导致局部出现炎症性反应，从而出现上述症状。通常情况下，婴儿的皮肤会出现瘙痒、发红等症状，家长可以使用肥皂水清洗婴儿局部，缓解不适症状。
3、外伤
如果婴儿不小心磕碰到大脚趾，可能会导致局部软组织损伤，从而引起局部发红、疼痛等症状。家长可以遵医嘱给婴儿外用碘伏、酒精等对患处进行消毒处理。
4、过敏
如果婴儿接触了花粉、尘螨等过敏原，可能会诱发过敏反应，从而导致局部皮肤出现瘙痒、发红等症状。家长可以在医生指导下给婴儿使用氯雷他定糖浆、盐酸西替利嗪口服溶液等药物进行抗过敏治疗。同时，家长应避免婴儿接触过敏原。
5、湿疹
湿疹是一种慢性、炎症性、瘙痒性皮肤病，患儿主要表现为皮肤出现红斑、丘疹、水疱等症状，部分患儿还会出现上述情况。建议患儿在医生指导下使用炉甘石洗剂、硼酸溶液等药物进行冲洗治疗。同时，患儿也可以遵医嘱使用糠酸莫米松乳膏、卤米松乳膏等涂抹患处进行治疗。
在日常生活中，需要注意保持室内清洁干燥卫生，勤通风换气。如果出现不适症状时应及时就医治疗。