小针刀手术有一定的风险，但一般风险性不高。
小针刀手术属于一种微创式的操作手法，是一种相对风险较小的治疗方法。小针刀是一种特殊的针具，针头有刀刃，可进行切割和铲拨。使用前必须进行高压蒸汽灭菌，或酒精浸泡消毒。主要用于治疗慢性疼痛，比如颈椎病、腰肌劳损、局部筋膜炎等，效果比较好，具有一定的安全性和有效性，通过治疗后也比较好恢复，通常风险程度不高。
小针刀在操作时使用的医疗器具一般比针灸稍粗一些，正确手法通常不会损伤深部组织，对身体不会造成太大影响。小针刀也是属于金属材料制成的针灸用具，如果医生对于解剖结构不是特别熟悉，可能会容易损伤到局部的血管神经。没有严格消毒的情况下，也会导致局部软组织感染，引起患者出现全身性的疼痛。
小针刀手术属于有创治疗，术后需要无菌纱布包扎覆盖，避免沾水感染。有出血倾向的患者，不能进行小针刀治疗。手术治疗后要注意观察恢复情况，适当休息，1-2天内局部严格制动，以免影响伤口愈合。