产检三维无异常，胎儿后期是否还会有畸形发生，需要根据具体情况进行判断，可能不会有畸形发生，但也可能会有畸形发生。
1、可能不会有畸形发生
在进行产检时，如果检查结果显示三维无异常，通常提示胎儿的发育正常，如果孕妇在怀孕期间注意饮食营养均衡，没有出现营养不良的情况，同时在医生的指导下定期去医院进行产检，通常可以有效降低胎儿畸形的发生概率，所以这种情况下，产检三维无异常，且其他检查无异常，则胎儿后期一般不会有畸形发生。
2、可能会有畸形发生
如果孕妇在怀孕期间没有注意饮食均衡，出现营养不良的情况，同时没有遵医嘱定期去医院进行产检，也可能会导致胎儿出现畸形。因为孕妇营养不良可能会导致胎儿的生长发育受到限制，从而出现畸形的情况。
在怀孕期间，孕妇应保证营养均衡，可以多吃富含维生素、蛋白质等的食物，如西红柿、鸡蛋、苹果等，有助于补充机体所需要的营养，同时也需要定期到医院进行产检，如果出现不适症状时，应及时就医治疗。