怀孕三个月拉大便都是黑色，可能是饮食因素、药物因素、消化性溃疡、痔、消化道出血等原因导致的，可根据原因对症处理。
1、饮食因素
如果患者在平时吃过多的动物肝脏、血制品等食物，这些食物中的铁元素含量比较高，如果没有被身体完全消化和吸收，会随着大便排出体外，从而出现大便颜色发黑的情况。一般不需要特殊处理，患者在停止食用上述食物后，上述情况会逐渐恢复正常。
2、药物因素
如果患者在怀孕期间服用含铁的药物，比如硫酸亚铁片、琥珀酸亚铁片等，会导致大便颜色发黑，这属于正常的现象，一般在患者停止服用药物后，大便的颜色会逐渐恢复正常。
3、消化性溃疡
如果患者患有消化性溃疡，胃肠道黏膜受到刺激，会引起肠道出血，血液在消化道内经过长时间消化，会产生硫化亚铁，从而出现上述症状。建议患者在医生的指导下使用铝碳酸镁片、枸橼酸铋钾胶囊等药物进行治疗，同时患者还要注意避免吃辛辣刺激的食物。
4、痔
该疾病可能与不良的排便习惯、长期低纤维饮食等因素有关，患者可能会出现便血、肛门瘙痒、疼痛等症状。建议患者可以在医生的指导下使用复方角菜酸酯栓等药物进行治疗，患者也要注意局部的清洁和护理，避免用手抓挠。
5、消化道出血
上述症状也可能是消化道出血导致的，如果患者在怀孕期间消化道黏膜受到损伤，可能会引起消化道出血，从而患者可能会出现上述情况。建议患者在医生的指导下使用奥美拉唑肠溶胶囊、兰索拉唑肠溶片等药物进行治疗。同时患者还要注意多休息，避免过度劳累。
建议患者及时去医院就医，明确疾病对症治疗。