一般没有明确的规定说明黄瓜籽在什么时候吃效果比较好，建议在饭后半小时到一小时吃黄瓜籽 。
黄瓜籽是葫芦科植物黄瓜的种子，有补钙、接骨、壮骨、强身的作用，对老年人的腰腿疼、骨质疏松、骨股头坏死都有很好的效果。在饭后半小时到一小时，胃肠道蠕动会逐渐形成一种协调的节奏。此时食用黄瓜籽，可以借助胃肠道的蠕动力量，使黄瓜籽在胃肠道中更好地移动，从而促进其营养成分的吸收。如果在饭前食用黄瓜籽，由于胃肠蠕动相对较弱，黄瓜籽可能在胃肠道中停留时间过长，不能及时被消化吸收，甚至可能引起胃部不适。
黄瓜籽虽然有一定的营养价值，但也不能过量食用，以免导致胃肠道负担过重，引起消化不良症状，因为黄瓜籽中的膳食纤维等成分在大量摄入时可能会对胃肠道功能产生影响。
部分人群可能对黄瓜籽过敏，过敏症状可能包括皮疹、瘙痒、呼吸急促、呕吐、腹泻等。如果是第一次食用黄瓜籽，应先少量尝试，观察是否有过敏反应。过敏体质的人群更要小心。黄瓜籽可以与一些食物搭配食用，以增强其营养效果。例如，可以与牛奶搭配，牛奶中的钙与黄瓜籽中的营养成分相互补充，有利于骨骼健康。但要避免与一些可能产生不良反应的食物一起食用，如菠菜等含草酸较多的食物，因为草酸可能与黄瓜籽中的钙结合，形成草酸钙沉淀，影响钙的吸收。