两个孕囊一个未见胚芽，可能是着床比较晚，也可能是孕囊发育不良、宫外孕、胎停育、葡萄胎等原因引起的，患者需要根据具体的原因进行相应的处理。
1、着床比较晚
两个孕囊则代表是双胎妊娠。在检查过程中出现此情况，可能是由于妊娠的时间比较短，另外一个孕囊胎心胎芽还没有出现。是正常现象，可以在一周到两周之后到医院进行复查，在此期间保持良好的心态，愉悦的心情，不要过度紧张。
2、孕囊发育不良
在妊娠的过程当中，由于母体摄入营养不足，导致孕囊发育缺乏营养，也会出现此情况。不需要太担心，因为双胎妊娠孕囊之间的发育也存在一定的差距。患者可以到医院再进行复查，如果出现了胎心和胎芽，不需要采取特殊的处理措施，只要定期做好孕检即可，如果没有出现胎心胎芽则需要及时通过清宫手术来进行处理。
3、宫外孕
宫外孕通常是指受精卵在子宫腔外着床发育的异常妊娠过程，可能与输卵管炎症、输卵管发育不良等因素有关。临床上一般会表现为阴道出血、腹痛等症状，部分孕妇可能会出现上述情况。建议患者可以通过妇科彩超、血HCG检查等方式明确诊断。如果确诊为宫外孕，患者可以在医生指导下使用甲氨蝶呤片、米非司酮片等药物进行治疗，也可以通过输卵管切除术等方式进行手术治疗。
4、胎停育
如果胚胎染色体存在异常，或者是女性在妊娠期间长期接触放射线、甲醛等有毒有害物质，可能会导致胎停育，从而出现上述情况。建议患者及时就医，可以通过妇科彩超、血HCG检查等方式明确诊断。如果确诊为胎停育，患者可以遵医嘱服用米索前列醇片、益母草颗粒等药物进行治疗，也可以通过刮宫术等方式进行手术治疗。
5、葡萄胎
葡萄胎是指女性怀孕时胚胎不正常发育，胎盘绒毛滋养细胞增生，间质高度水肿，形成大小不一的水泡，水泡间相连成串形如葡萄。建议患者在医生指导下通过清宫术、子宫切除术等方式进行治疗。同时，患者也可以在医生指导下使用环磷酰胺片、氟尿嘧啶注射液等药物进行化疗。
如果出现不适症状，建议患者及时就医，明确具体病因后进行对症治疗，以免延误病情。另外，患者在怀孕过程中，饮食要营养搭配均衡，多吃一些高蛋白、高维生素、高钙的食物来增强体质，也有助于胎儿的生长发育，平时也可以适当的补充一些多种微量元素和钙片，都有助于胎儿的生长发育，避免做剧烈的运动。