牛黄素和牛磺酸的区别主要在于来源、结构、功效、作用、不良反应等方面。
1、来源
牛黄素是一种从牛胆管中提取的药物，而牛磺酸则主要是从牛磺胆酸中提取的一种氨基酸。
2、结构
牛黄素的化学名为β-氨基丙酰乙酸，是由1个β-氨基丙酸与5个羟基甲基甘氨酸通过共价键结合而成。而牛磺酸的化学名称为β-氨基丙酰乙酸，是由谷氨酸和甘氨酸在谷氨酰转肽酶作用下形成的谷氨酸衍生物。
3、功效
牛黄素具有清热解毒的功效，也具有息风止痉的作用，可以用于治疗热病神昏、惊风抽搐等不适现象。而牛磺酸具有镇痛、利胆的作用，也具有抗炎的效果，可以用于治疗急性结膜炎、病毒性肝炎等疾病引起的不适现象。
4、作用
牛黄素主要用于治疗急性扁桃体炎、小儿急性肠胃炎、不明原因的高热等疾病的治疗。而牛磺酸主要用于治疗感冒初期、发热等病症的治疗。
5、不良反应
部分患者使用牛黄素后可能会出现头晕、腹痛、腹泻等不良反应，如果症状比较轻微，一般不需要特殊治疗，如果症状比较严重，建议立即停止使用并及时就医治疗。而部分患者使用牛磺酸后可能会出现皮疹、瘙痒等不良反应，如果症状比较轻微，一般不需要特殊治疗，如果症状比较严重，建议立即停止使用并就医治疗。
在日常生活中，患者需要在医生的指导下合理用药，避免私自盲目服用。另外，还要注意用药期间的饮食健康，尽量吃清淡类的食物，不建议吃生冷寒凉类的食物，也不可以吃辛辣刺激性的食物，否则可能会影响到药物的吸收。