降纤酶和巴曲酶的区别主要包括药物成分不同、适应证不同、药理作用不同、药物半衰期不同、注意事项不同等，患者需要在医生的指导下用药。
1、药物成分不同
降纤酶主要成分为水蛭素，是从水蛭中提取的一种蛋白酶抑制剂。巴曲酶主要成分为小分子肽，是从巴西蝮蛇中提取的一种蛋白酶抑制剂。
2、适应证不同
降纤酶主要用于治疗血栓栓塞性疾病，如脑血栓、心肌梗死等，也可以用于治疗高脂血症、糖尿病等疾病。巴曲酶主要用于治疗急性脑血管病、慢性脑血管病及其他缺血性血管疾病，也可以用于治疗血栓性血小板减少性紫癜、肝硬化、肺栓塞等。
3、药理作用不同
降纤酶可以降低血液的黏稠度，还可以促进血液的循环，改善血液的高凝状态。巴曲酶可以降低血液的黏稠度，还可以促进血液的循环，改善血液的高凝状态。
4、药物半衰期不同
降纤酶半衰期较短，一般为1.5小时左右，而巴曲酶半衰期较长，一般为5小时左右。
5、注意事项不同
使用降纤酶时，需要注意对药物成分过敏者禁用，孕妇以及哺乳期女性需要慎用。使用巴曲酶时，需要注意对药物成分过敏者禁用，以免引起过敏反应。
如果患者需要使用上述药物，建议及时到正规医院，在医生的指导下进行使用，避免自行用药，以免出现不良反应，导致病情加重。如果患者出现不适症状，建议及时就医治疗。