百日咳综合征和百日咳的区别在于病因不同、症状不同、治疗方式、传染性不同、病程长短不同等。
1、病因不同
百日咳是由百日咳杆菌感染引起的一种急性呼吸道传染病，属于国家法定乙类传染病。而百日咳综合征是由百日咳杆菌感染引起的，是一种临床综合征，不属于法定传染病。
2、症状不同
百日咳患者会出现典型的阵发性、痉挛性咳嗽，咳嗽终末会出现鸡鸣样吸气性吼声。而百日咳综合征患者会出现咳嗽、打喷嚏、流泪等症状，还可能会出现夜间咳嗽、体重减轻、厌食等症状。
3、治疗方式不同
百日咳患者可以在医生的指导下服用阿奇霉素分散片、罗红霉素胶囊等药物进行治疗。而百日咳综合征患者可遵医嘱服用阿莫西林胶囊、红霉素肠溶胶囊等药物进行治疗，还可以通过雾化吸入的方式进行治疗。
4、传染性不同
百日咳综合征是一种传染性疾病，由百日咳杆菌感染引起，主要通过呼吸道传播。而百日咳是一种呼吸道疾病，不属于传染病。
5、病程长短不同
百日咳综合征的病程相对较长，一般需要2-3个月的时间才能恢复。而百日咳综合征的病程相对较短，一般在5-7天即可恢复。
在日常生活中，患者要做好防护措施，出门时佩戴口罩，避免去人多密集的地方。如果出现咳嗽、咳痰等症状，患者可以到正规医院就诊治疗，以免延误病情。