光动力治疗三次还有疣体，可能是治疗不彻底、免疫力低下、再次感染、皮肤受到损伤、药物过敏等原因所造成的，患者需要根据具体的原因进行针对性处理。
1、治疗不彻底
光动力治疗是一种物理治疗方法，主要用于治疗尖锐湿疣、带状疱疹、扁平疣等疾病。如果患者在治疗期间，没有按照医生的指导进行治疗，可能会导致治疗不彻底，从而出现上述症状。患者可以遵医嘱配合使用重组人干扰素α2b凝胶、咪喹莫特乳膏等药物进行治疗，也可以通过激光治疗的方式进行处理。
2、免疫力低下
如果患者在治疗期间不注意平时的护理，导致身体免疫力低下，可能会使身体更容易受到人乳头瘤病毒的感染，也会出现疣体复发的情况。建议患者适当进行体育锻炼，比如跑步、游泳等，也可以多吃富含优质蛋白的食物，比如鸡蛋、牛奶等，在一定程度上也可以增强自身的免疫力。
3、再次感染
如果患者在治疗期间没有注意做好局部的卫生清洁，或者是经常到公共浴池洗澡，可能会导致再次感染，也会出现上述症状。建议患者在治疗期间需要注意做好局部卫生清洁，避免与他人共用浴巾、浴缸等，以免引起交叉感染的情况。
4、皮肤受到损伤
如果在治疗期间，患者的皮肤受到了损伤，也未得到及时有效地治疗，此时可能会使人乳头瘤病毒再次感染皮肤，也会出现疣体复发的情况。患者可以通过液氮冷冻、二氧化碳激光等方式进行去除。
5、药物过敏
如果患者属于过敏性体质，而且对光动力治疗使用的药物过敏，此时在治疗以后可能会诱发过敏反应，从而出现皮肤红肿、皮肤瘙痒等现象。建议患者及时停止使用该药物，也可以遵医嘱配合使用氯雷他定胶囊、盐酸西替利嗪胶囊等药物进行治疗。
在日常生活中，患者要注意平时的护理，避免频繁更换性伴侣，也要避免频繁进行性生活，否则会增加交叉感染的概率。