出生五天的宝宝可以遵医嘱吃益生菌，但是需要在医生的指导下服用，家长不可盲目给宝宝用药。
出生五天的宝宝胃肠道功能发育不完善，如果喂养不当，可能会引起消化不良，从而出现腹泻、腹胀等不适症状。益生菌可以有效调节肠道菌群，改善菌群失调引起的腹泻、便秘等不适症状，还可以有效缓解便秘症状。如果出生五天的宝宝出现上述不适症状，家长可以在医生的指导下给宝宝服用益生菌，以缓解不适症状。但是家长需要注意避免擅自给宝宝服用药物，以免使用不当，引起不良反应，导致病情加重。
在日常生活中，家长还需要注意宝宝的喂养，如果是奶粉喂养，家长应选择合适的奶粉，如果是母乳喂养，家长应注意自身的饮食健康，多吃富含维生素以及蛋白质的食物，少吃辛辣刺激油腻的食物。同时还要注意作息规律，保证充足的睡眠时间，避免熬夜。