梅毒3个月查不出来的概率一般不大，因为梅毒感染后通常在2-4周内具有传染性，此时进行检查就可以查出来。
梅毒是由梅毒螺旋体感染引起的一种慢性系统性的性传播疾病，主要通过性接触传播、母婴传播和血液传播。梅毒患者是梅毒的传染源，患者的皮肤损害、血液、精液、乳汁和唾液中均含有梅毒螺旋体。部分梅毒患者可出现咽部梅毒，表现为咽喉疼痛、吞咽困难、声音嘶哑等，少数患者还可出现骨梅毒，表现为病理性骨折、骨穿孔、关节畸形等。如果患者存在高危性行为，应及时到医院皮肤性病科进行梅毒血清学检查，可以通过梅毒螺旋体血清试验等方式进行判断。如果结果显示阳性，则说明患者可能感染了梅毒螺旋体。如果结果显示阴性，则说明患者没有感染梅毒螺旋体。因此，3个月时检测是否感染梅毒查不出来的概率一般不大。
建议患者在日常生活中注意做好个人防护，避免与家人共用生活用品，以免发生传染。同时，还应注意保持良好的生活习惯，避免过度劳累，注意劳逸结合，以免引起不适症状。