两次药流以后是否还能正常怀孕与药流是否成功或完全、药流后是否有后遗症的发生有较大的关系，并不取决于药流的次数。
1、药流是否成功
药流通常是指用米非司酮片加米索前列醇药物口服终止49天之内的妊娠，前者使子宫蜕膜变性坏死、宫颈软化，后者使子宫兴奋、子宫收缩，促使胚胎排出。但药流并非是百分之百会成功，其成功与否，主要取决于孕妇自身的敏感性和胚胎本身的特点等因素。一旦药流失败，可能引起孕妇大出血和感染，需要及时进行刮宫处理。若残留较大，无法通过服用药物排出，也需要进行刮宫处理。若两次都进行了刮宫处理，会导致子宫内膜比较薄，其正常受孕相对困难。但如果两次药流都成功且完全，没有进行刮宫处理，一般对子宫内膜的影响不大，通常可以正常怀孕。
2、药流后是否有后遗症
通常，药流失败或不完全的情况下，更容易导致感染的发生。但即使药流成功后也需要及时口服抗生素预防感染，注意好阴道的环境卫生，避免性生活。否则，容易引起输卵管炎、输卵管堵塞、子宫内膜炎、子宫内膜异位等情况的发生，情况严重的可能导致不孕，很难正常怀孕。但如果两次药流成功后没有出现炎症、感染等情况，一般不会影响正常怀孕。
因为药流有可能失败或不完全， 且药流有很强的适应证，因此不建议自行买药进行流产。建议在有急诊处理、刮宫条件和输血输液条件的医院进行药流，多加观察，以防不测。