肾囊肿出血是否会自愈，要取决于出血量的多少来判断，少量的出血有可能会自愈，大量的出血可能无法自愈。
肾囊肿是肾脏疾病中比较常见的一种结构异常性疾病，会发生在肾脏的表面，可能与遗传、肾脏炎症、局部感染、不良的生活习惯等因素有关。肾囊肿可能会压迫肾实质，引起血管闭塞，导致出血的情况。如果肾囊肿的体积比较小，只是出现了少量的出血，没有伴随明显的不适症状，通常是可以自愈的，患者不需要过多担心。但是，如果肾囊肿的体积比较大，出现了中量到大量的出血，或者是肾囊肿发生破裂，则可能没有办法自愈，患者需要在医生的指导下及时进行干预，积极治疗。
肾囊肿患者如果有异常出血的情况，建议及时到正规医院进行超声检查、增强CT检查、核磁共振检查等检查来确诊，并在医生的指导下使用腹腔镜下的肾囊肿去顶减压术、穿刺硬化治疗、腹腔镜肾囊肿切除术等手术方式进行治疗。