蹲着后膝盖疼，多考虑是过度劳累、外伤等原因造成的，也不排除是半月板损伤，建议及时就医治疗。
1、过度劳累
如果患者平时经常从事重体力劳动，可能会导致膝盖部位过度损伤，在蹲着时，膝盖部位的负担加重，从而出现膝盖不适等症状。建议患者注意多休息，避免过度劳累，也要避免从事重体力劳动。
2、外伤
如果患者膝盖部位受到外力撞击或敲击，可能会导致局部软组织损伤，在蹲着时，可能会使损伤部位受到压迫，从而出现疼痛、红肿等情况。24小时内患者可以通过冰袋冷敷的方式进行缓解；但24小时后则需要患者对局部位置进行热敷，促进血液循环。必要时，患者也可遵医嘱服用三七伤药片、大活络胶囊等药物治疗。
3、半月板损伤
如果患者半月板出现损伤，在下蹲时，膝盖部位会受到压力，也可能会导致半月板损伤加重，出现剧烈疼痛、活动受限等情况。患者可以通过半月板成形术或半月板修复术等进行治疗，也可以通过局部按摩、热敷等方式缓解不适。
除此之外，还可能是膝关节炎、膝关节滑膜炎、髌腱炎等原因造成的，建议患者及时就医治疗，以免延误病情。