黄连和大黄的功效具有相同之处，也具有不同之处。两者的区别在于植物来源、功效、应用以及禁忌等。
1、相同之处
黄连为毛茛科黄连属植物黄连、三角叶黄连、云连的干燥根茎，而大黄是蓼科黄连属植物掌叶大黄、唐古特大黄的干燥根茎。
2、不同之处
黄连性味苦寒，入心、脾、胃、肝、胆、大肠经，具有清热燥湿、泻火解毒、止血、安胎的功效，适用于治疗湿热痞满、呕吐吞酸、泻痢、黄疸、高热神昏、心火亢盛、心神不宁、血热吐衄、目赤、牙痛、消渴、痈肿疔疮等病症。大黄是蓼科黄连属植物掌叶大黄、唐古特大黄的干燥根茎，具有泻下攻积、清热泻火、凉血解毒、止血、逐瘀通经的功效，适用于治疗积滞便秘、热毒血痢、湿热泻痢、黄疸、淋证、水火烫伤、咽喉肿痛、牙痛、跌打损伤、痈肿疮疡等病症。
需要注意的是，两者均为清热药，而且苦寒之品容易损伤脾胃，所以脾胃虚弱的患者慎用，同时在用药期间，还要忌食辛辣、刺激、油腻的食物，以免影响药效。另外，黄连和大黄需要在医生指导下进行用药，不可以私自用药，以免出现不良反应，例如腹泻、呕吐等。