甲流一般是指甲型流感，通常情况下，甲型流感后期患者出现小腿肌肉酸痛的情况可能是由于病情加重引起的，也可能是过度劳累、受凉、缺钙、风湿性关节炎等原因引起的。建议患者及时就医，在医生指导下进行针对性治疗。
1、病情加重
甲型流感是由甲型流感病毒感染引起的急性呼吸道传染病，主要通过飞沫传播和接触传播的方式传染给他人。如果患者的病情没有得到有效的控制，并且出现了持续高热的症状，则可能会导致体内乳酸堆积过多，从而出现小腿肌肉酸痛的情况。
2、过度劳累
如果甲型流感患者休息不足或过度劳累，容易出现免疫力下降的情况，也会引发上述症状。患者应多注意休息，同时还可以通过局部热敷的方式，加快血液循环，缓解疼痛症状。
3、受凉
如果没有做好保暖措施，受到寒风刺激以后会增加患病风险，甚至会出现关节肿胀和疼痛等症状，还可能伴有上述现象。可以适当喝热水进行改善，也要加强自身的保暖措施。
4、缺钙
可能是体内的钙元素摄入不足所造成的，会使血液中钙含量减少，导致肌肉异常收缩，造成小腿肌肉痉挛和上述情况的发生。可以在医生指导下服用碳酸钙D3咀嚼片、葡萄糖酸钙口服溶液等补钙类药物进行治疗。
5、风湿性关节炎
可能与家族遗传因素有关，发病期间容易造成四肢僵硬、红肿以及灼烧感等情况，还可能会出现上述情况。可以遵医嘱服用地塞米松片、醋酸泼尼松龙片等药物进行抗感染治疗，必要时还可以采取手术切开引流的方法来辅助改善。
当患者出现以上症状后应及时前往正规医院就诊并积极配合医生规范化诊治，以免延误病情影响身体健康。