酸奶具有润肠通便、补充营养、促进肠道蠕动、补钙等多种好处。但长期饮用酸奶或饮用过量，也可能产生腹泻、腹痛等不适症状。
酸奶中含有大量活性乳酸菌、益生菌，可促进肠道菌群平衡，利于食物消化，因此便秘人群可适量饮用。此外，酸奶中含有丰富的蛋白质、维生素等营养元素，适量饮用酸奶可补充营养，酸奶中含有丰富的钙质，青少年、妊娠期女性、绝经期女性钙流失较快，适量饮用酸奶可补钙。
值得注意的是，胃肠道不适的患者，饮用过量可能加重腹泻、腹痛等症状，高钙血症患者若长期过量饮用，也可能导致血液中钙含量过高，引起不适症状。因此，酸奶应注意购买正规厂家生产的酸奶，注意饮用量和饮用时间。另外，购买酸奶时应注意观察酸奶的保质期，若酸奶过期则不可饮用。