南瓜籽具有补充营养、辅助降压、辅助降胆固醇等功效，但也存在一定副作用，如引起过敏、胃肠道不适等。
1、功效
南瓜籽中富含丰富的脂肪、蛋白质、膳食纤维、维生素及矿物质等营养成分，能够起到补充营养作用。南瓜籽中的钾元素含量较为丰富，食用后可以起到一定的辅助降血压的功效。南瓜籽中含有较多的不饱和脂肪酸，不饱和脂肪酸具有一定降低胆固醇的作用，对于防止动脉粥样硬化也具有一定的辅助效果。
2、副作用
部分人群会对南瓜籽产生过敏反应，食用后会出现皮肤瘙痒、红肿等症状，此类人群应禁止食用。如果大量食用南瓜籽，可能会引起消化不良，导致出现腹痛、腹泻等症状。
此外，对于婴幼儿、老年人及患有胃肠道疾病的人群来说，应注意避免食用。