粪便基因检测和肠镜检查都是检测肠道是否存在病变的手段，无法进行比较哪个更准确，两者都可以有效检测肠道是否存在病变。
1、粪便基因检测
粪便基因检测是利用基因检测技术，检测粪便中的菌群基因片段，来判断肠道是否存在病变。其检测方式，可用来判断腹泻患者是否存在菌群失调的情况，有利于医生帮助患者较好的治疗。通常分为正常、轻度菌群失调、中度菌群失调以及重度菌群失调。
2、肠镜
肠镜是一种医学检查方法，通过纤维导管从肛门进入结肠，医生可以观察到结肠和直肠的内部情况。可以用来检测直肠、结肠中是否出现病变，比如息肉、肿瘤等。通常分为普通检查、无痛肠镜和胶囊肠镜。肠镜检查前6-8小时患者需禁食，有利于提高检查结果的准确性。
如果存在肠道不适症状，建议患者根据自身情况选择合适的检查方式，明确诊断后在医生指导下积极治疗。日常生活中要注意饮食，建议清淡饮食，少吃油腻、辛辣的食物，平时应注意适量运动，避免精神压力，保证睡眠质量。